Петушков Иван Владимирович | Институт молекулярной генетики
Ученая степень:
без ученой степени

Ученое звание:
без ученого звания


Подразделение ИМГ:
Лаборатория молекулярной генетики микроорганизмов

Должность в ИМГ:
Инженер


Телефон:
+7-499-196-00-15

Адрес электронной почты:
telomer1@rambler.ru



Основные научные интересы, направления исследований и результаты

Основные труды посвящены изучению роли специфических контактов бактериальной РНК-полимеразы с нематричной цепью ДНК на всех стадиях транскрипции. Было продемонстрировано, что узнавание сигналов пауз транскрипции происходит при участии CRE-кармана β-субъединицы РНК-полимеразы, причём эти взаимодействия регулируются вторичной структурой РНК-транскрипта (Petushkov et al., 2015 Nucl. Acids Res. 43:5798-5809.). Был открыт и подробно охарактеризован новый вид транскрипционных пауз, вызванных альтернативной σ38-субъединицей (Petushkov et al., 2017 Nucl. Acids Res. 45(6):3006-3016). Продемонстрировано, что сигнал σ38-зависимой паузы играет роль в регуляции экспрессии генов, предположительно подавляя связывание белка-репрессора с промоторной областью гена (Petushkov et al., 2017 RNA biology 14(12):1678-1682). Изучалась кинетика ухода РНК-полимеразы с промотора, роль района 3.2 σ-субъединицы и влияние транскрипционных факторов, связывающихся со вторичным каналом, на скорость этого процесса (Petushkov et al., 2017 Biochemical Journal 474(24):4053-4064). Другим важным направлением исследований (совместно с Алёной Макаровой и Наталией Миропольской) был поиск активного центра dRP-лиазной активности полимеразы «йота» (Miropolskaya et al., 2017 Sci Rep 7(1):10194). В настоящий момент ведутся работы по изучению механизмов перехода от стадии инициации к элонгации транскрипции, и роли паузы во время инициации в этом процессе, а также особенностей транскрипции у бактерии Mycobacterium tuberculosis. Также проводятся совместные работы с лабораторией Алексея Аравина по изучению структурных характеристик комплексов белков-Аргонавтов с нуклеиновыми кислотами.


Преподавательская деятельность, руководство диссертациями

Руководитель дипломной работой студента МГУ имен М.В.Ломоносова Шикалова Александра (бакалаврский диплом, 2018 г.)



Премии, заслуги, членство в научных обществах

Член Российского общества биохимиков и молекулярных биологов при Российской академии наук
1) Диплом за лучший устный доклад секции молекулярная биология 18-й Международной Пущинской школы-конференции молодых учёных.
2) Диплом за лучший устный доклад секции молекулярная биология 19-й Международной Пущинской школы-конференции молодых учёных.
3) Диплом III степени за постерное сообщение VII Российском симпозиуме «Белки и пептды».
4) Стипендия FEBS на участие в 17-м форуме молодых учёных и 42-м конгрессе FEBS.



Список публикаций

  1. Petushkov I, Pupov D, Bass I, Kulbachinskiy A Mutations in the CRE pocket of bacterial RNA polymerase affect multiple steps of transcription // Nucleic Acids Res.. - 2015. - №43. - p. 5798-809.
  2. Petushkov I, Esyunina D, Kulbachinskiy A. σ38-dependent promoter-proximal pausing by bacterial RNA polymerase // Nucleic Acids Res.. - 2017. - №45. - p. 3006-3016.
  3. Petushkov I, Esyunina D, Kulbachinskiy A Possible roles of σ-dependent RNA polymerase pausing in transcription regulation // RNA Biol.. - 2017. - №14. - p. 1678-1682.
  4. Miropolskaya N, Petushkov I, Kulbachinskiy A, Makarova AV. Identification of amino acid residues involved in the dRP-lyase activity of human Pol ι // Sci Rep. - 2017. -7(1): С. 10194.
  5. Petushkov I, Esyunina D, Mekler V, Severinov K, Pupov D, Kulbachinskiy A Interplay between σ region 3.2 and secondary channel factors during promoter escape by bacterial RNA polymerase // Biochemical Journal. - 2017. - №474. - p. 4053-4064.