Лунина Наталия Александровна | Институт молекулярной генетики

Лунина Наталия Александровна

Ученая степень:
кандидат биологических наук

Ученое звание:
без ученого звания


Подразделение ИМГ:
Лаборатория белковой инженерии

Должность в ИМГ:
Научный сотрудник


Телефон:
+7-499-196-02-05

Адрес электронной почты:
lunina@img.ras.ru



Основные научные интересы, направления исследований и результаты

После окончания кафедры вирусологии и аспирантуры Биологического факультета МГУ,  защитила кандидатскую диссертацию по теме «Трансляция РНК вируса штриховатой мозаики ячменя в бесклеточной системе» под руководством академика И.Г. Атабекова. Продолжала работать на кафедре вирусологии, изучала РНК-содержащие вирусы растений, в том числе структуру РНК генома клостеровирусов, результаты этих исследований опубликованы в ведущих вирусологических журналах. Всего по этому направлению 11 публикаций.
С марта 1998 года перешла на работу в ИМГ РАН в лабораторию молекулярной генетики анаэробов под руководством Великодворской Г.А. Основным направлением работы стало исследование термофильных гликозилгидролаз, способных к работе при экстремально высоких температурах (до 90˚С). Проведено изучение ферментов амилазного комплекса, в том числе кластера генов участвующих в гидролизе мальтодекстринов. Исследованы мультимодульные ферменты: получены и изучены функции отдельных модулей, в том числе каталитических и углеводсвязывающих. Сконструирована химерная термостабильная лактаза способная прочно связываться с целлюлозой и гидролизовать лактозу в молочной сыворотке. Охарактеризован углеводсвязывающий модуль нового неизвестного ранее семейства, способный связываться с хитином и хитозаном. По этому направлению - 18 публикаций и патент.
С 2006 года – научный сотрудник лаборатории белковой инженерии ОМГОБиБИ под руководством чл.-корр. РАН С.В. Кострова. Участвовала в исследованиях вирусных протеаз как возможных противораковых агентов. В том числе в работе по исследованию механизма клеточной гибели, вызываемой протеазой 3С вируса гепатита А. По этой теме опубликованы 2 работы.


Преподавательская деятельность, руководство диссертациями

Обучала экспериментальной работе студентов, вела большой практикум на кафедре вирусологии Биологического факультета МГУ.
Руководитель около 10 дипломных работ студентов и одной кандидатской диссертации. 


Список публикаций

  1. Dolja V.V., Sokolova (Lunina) N.A., Tjulkina L.G., Atabekov J.G. A study of barley stripe mosaic virus genome. II. Translation of individual RNA species of two BSMV strains in a homologous cell-free system. Mol.Gen.Genet., 1979, 175, 93-97.
  2. Доля В.В., Лунина Н.А., Атабеков И.Г. Изучение трансляции отдельных РНК четырехкомпонентного штамма ВШМЯ в гетерологичной бесклеточной системе.  Труды ЛСХА, 1981, 191, 49-52.
  3. Доля В.В., Лунина Н.А., Смирнов В.Д., Карпов В. А., Худяков Ю.Е., Козлов Ю.В., Баев А.А., Атабеков И.Г. Локализация генов в полицистронных мРНК методом олигонуклеотидного зондирования на примере гена белка оболочки вируса штриховатой мозаики ячменя. Доклады АН СССР, 1982, 265, 474-477.
  4. Баратова Л.А., Белянова Л.П., Ходова А.М., Лунина Н.А., Доля В.В., Атабеков И.Г. Протяженные N-концевые аминокислотные последовательности структурных белков двух штаммов вируса штриховатой мозаики ячменя. Биол. науки, 1983, №4, 23-26.
  5. Dolja V.V., Agranovsky A.A., Lunina N.A., Atabekov J.G. Short virion RNA in barley stripe mosaic virus. FEBS lett., 1983, 151, 215-218.
  6. Dolja V.V., Lunina N.A., Leiser R.-M., Stanarius T., Belzhelarskaya S.N., Kozlov Y.V., Atabekov J.G. A comparative study on the in vitro translation products of individual RNAs of two-, three-, and four-component strains of barley stripe mosaic virus. Virology, 1983, 127, 1-14.
  7. Доля В.В., Лунина Н.А., Чумаков К.М., Циглер А., Атабеков И.Г. Субгеномные РНК вируса штриховатой мозаики ячменя. Доклады АН СССР, 1986, 288, 999-1001.
  8. Доля В.В., Лунина Н.А., Карпова О.В., Родионова Н.П., Тюлькина Л.Г., Кулаева О.И., Атабеков И.Г. Длина внутреннего поли(А)-блока генетически детерминирована для каждой индивидуальной РНК вируса штриховатой мозаики ячменя. Известия Академии Наук СССР, Серия Биологическая, 1989, №1, стр.133-137.
  9. Agranovsky, A.A., Boyko, V.P., Karasev, A.V., Lunina, N.A., Koonin, E.V., and   Dolja,V.V. Nucleotide sequence of the 3`-terminal half of beet yellows  closterovirus RNA genome: unique arrangement of eight virus genes. Journal of  General Virology, 1991, 72, 15-23.
  10. Agranovsky,A.A., Karasev, A.V., Novikov V.K., Lunina N.A., Loginov, S., and   Tyulkina, L.G. Poa semilatent virus, a hordeivirus having no internal polydisperse poly(A) in the 3` non-coding region of the RNA genome. Journal of General Virology, 1992, 73, 2085-2092.
  11. Agranovsky, A.A., Koonin, E.V., Boyko, V.P., Maiss, E., Froetschl, R., Lunina N.A. and Atabekov, J.G. Beet yellows closterovirus: complete genome structure and identification of a leader papain-like thiol protease. Virology, 1994, 198, 311-324.
  12. Зверлов В.В., Волков И.Ю., Лунина Н.А., Великодворская Г.А. Ферменты термофильных анаэробных бактерий, гидролизующие целлюлозу, ксилан и другие  -глюканы. Молекулярная биология, 1999, 33, с.106-112.
  13. Березина О.В., Зверлов В.В., Лунина Н.А., Чекановская Л.А., Дубинина Е.Н., Либель В., Великодворская Г.А.  Структура гена и свойства термостабильной  4- альфа-глюканотрансферазы из Thermotoga neapolitana. Молекулярная биология, 1999,  33, №5, с. 905-911.
  14. Zolotarev Y.A., Dadayan A.K., Borisov Y.A., Dorokhova E.M., Kozik V.S., Vtyurin N.N., Bocharov E.V., Ziganshin R.N., Lunina N.A., Kostrov S.V., Ovchinnikova T.V., Myasoedov N.F. The effect of three-dimensional structure on the solid state isotope exchange of hydrogen in polypeptides with spillover hydrogen. Bioorganical Chemistry, 2003, 31, 453-463.
  15. Veith, B., Zverlov, V. V., Lunina, N. A., Berezina, O. V., Raasch, C., Velikodvorskaya, G. A., and Liebl, W. Comparative analysis of the recombinant α-glucosidases from the Thermotoga neapolitana and Thermotoga maritima maltodextrin utilization gene clusters. Biocatalysis and Biotransformation. 2003, 21, 147-158.
  16. Березина О. В., Лунина Н.А., Зверлов В.В.,  Наумов Д.Г., Либель В., Великодворская Г. А. Кластер генов  Thermotoga neapolitana, участвующих в деградации крахмала и мальтодекстринов: молекулярная  структура локуса. Мол. Биол., 2003, 37, 801-809.
  17. Лунина Н.А.,  Березина О.В.,  Вейс Б.,  Зверлов В.В.,  Воробьева И.П., Чекановская Л.А., Хромов И.С.,  Рааш Г.,  Либель В., Великодворская Г. А. Кластер генов Thermotoga neapolitana, участвующих в деградации крахмала и мальтодекстринов: экспрессия генов aglB и aglA в E. coli, свойства рекомбинантных ферментов. Мол. Биол., 2003,  37, 810-819.
  18. Волков И.Ю., Лунина Н.А. Великодворская Г.А. Перспективы практического применения субстрат-связывающих модулей гликозилгидролаз. Прикладная биохимия и микробиология, 2004, 40, 5, 499 - 504.
  19. Волков И.Ю., Лунина Н.А., Березина О.В., Великодворская Г.А. и Зверлов В.В.  Кластер генов Thermoanaerobacter ethanolicus, содержащий гены альфа- и бета-галактозидаз (melA) и (lacA), и свойства рекомбинантного белка LacA. Мол. биол., 2005, 39, 5, 1-8.
  20. Dvortsov I.A., Lunina N.A., Chekanovskaya L.A., Shedova E.N., Gening L.V., Velikodvorskaya G.A. Ethidium bromide is good not only for staining of nucleic acids but also for staining of proteins after polyacrylamide gel soaking in trichloroacetic acid solution. Analytical Biochemistry, 2006, 253, (2), 293-295.
  21. Lunina N.A., Agafonova E.V., Chekanovskaja L.A., Dvortsov I.A., Berezina O.V., Shedova E.N., Kostrov S.V., Velikodvorskaya G.A. Co-expression of the Thermotoga neapolitana aglB Gene with an Upstream 3’-Coding Fragment of the malG Gene Improves Enzymatic Characteristics of Recombinant AglB Cyclomaltodextrinase. Protein Expression and Purification, 2007, 54, 18-23.
  22.  Шедова Е.Н., Березина О.В., Лунина Н.А., Зверлов В.В., Шварц В. Н., Великодворская Г.А. Клонирование и характеристика протяженного фрагмента метагеномной ДНК, содержащего гены гликозилгидролаз. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2009, 1, 11-15.
  23. Шедова Е.Н., Лунина Н.А., Березина О.В., Зверлов В.В., Шварц В.Н., Великодворская Г.А.  Экспрессия в Escherichia coli генов сelА и xylА, изолированных из фрагмента метагеномной ДНК. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 2009, 2, 28-32.
  24.  Dvortsov I.A., Lunina N.A., Chekanovskaya L.A., Schwarz W.H., Zverlov V.V., Velikodvorskaya G.A. Carbohydrate binding properties of a separately folding protein module from {beta}-1,3-glucanase Lic16A of Clostridium thermocellum. Microbiology, 2009, 155, 2442-2449.
  25. Дворцов И. А., Лунина Н. А., Зверлов В. В.,  Великодворская Г. А. Субстрат связывающие свойства модуля  СВМ54 ламинариназы Lic16A из Clostridium thermocellum. Молекулярная биология, 2010, том 44, № 3, с. 671–676.
  26. Velikodvorskaya G.A.,  Tikhonova T.V., Gurvits I.D., Karyagina A.S., Lavrova N.V., Sergienko O.V., Tashlitskii V.N., Lunina N.A., and Lunin V.G. Сhimeric lactase capable of spontaneous and strong immobilization on cellulose and development of continuous-flow system for lactose hydrolysis at high temperatures,  Appl. and Envir. Microbiol., 2010,  76, N.24, 8071-8075.
  27. Шубин А.В., Лунина Н.А., Шедова Е.Н., Рощина М.П., Демидюк И.В., Виноградова Т.В., Копанцев Е.П., Чернов И.П., Костров С.В. Оценка токсического эффекта при транзиентной экспрессии в клетках линии HEK 293 генов протеаз патогенов человека. Биотехнология, 2012, № 4, 82-88.
  28. Дворцов И. А., Лунина Н. А., Зверлов В. В., Великодворская Г. А. Свойства четырёх С-концевых углевод-связывающих модулей (СВМ4)  ламинариназы LicA Clostridium thermocellum.  Мол. Биол., 2012, 46, №6, 915-921.
  29. Великодворская Г. А., Чекановская Л. А., Лунина Н. А., Сергиенко О. В., Лунин В. Г., Дворцов И. А., Зверлов В.В. Углевод-связывающий модуль 28 семейства термостабильной эндо-1,4-β-глюканазы CelD из анаэробного микроорганизма Сaldicellulosiruptor bescii необходим для максимальной активности фермента и необратимо связывается с аморфной целлюлозой. Мол. Биол., 2013, 47, №4, 667-673.
  30. Kislitsyn Y.A., Samygina V.R., Dvortsov I.A., Lunina N.A., Kuranova I.P.  and Velikodvorskaya G.A. Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of the family 54 carbohydrate-binding module from laminarinase (β-1,3-glucanase) Lic16A of Clostridium thermocellum. Acta Cryst., 2015, F71, 217-220.
  31. Shubin A.V., Demidyuk I.V., Lunina N.A., Komissarov A.A., Roschina M.P., Leonova O.G.  and Kostrov S.V. Protease 3C of hepatitis A virus induces vacuolization of lysosomal/endosomal organelles and caspase-independent cell death. BMC Cell Biology, 2015, 16:4, DOI 10.1186/s12860-015-0050-z.
 
              Патент на изобретение №2278160, зарег. 20 июня 2006 г.
              Великодворская Г.А., Зверлов В.В., Карягина-Жулина А.С., Лаврова Н.В., Лунин В.Г., Лунина Н.А., Рязанова Е.М., Сергиенко О.В., Тихонова Т.В. Рекомбинантный белок LACspCBD, обладающий бета-галактозидазной активностью и способностью самопроизвольно связываться с целлюлозосодержащими сорбентами, рекомбинантная плазмидная ДНК, кодирующая синтез рекомбинантного белка LACspCBD, штамм Escherichia coli M15 [pREP4, pLACspCBD] – продуцент рекомбинантного белка LACspCBD, способ получения иммобилизованного рекомбинантного белка LACspCBD на целлюлозе и способ ферментативного расщепления лактозы.