Есюнина Дарья Михайловна | Институт молекулярной генетики РАН

Есюнина Дарья Михайловна

Ученая степень:
кандидат биологических наук

Ученое звание:
без ученого звания


Подразделение ИМГ:
Лаборатория молекулярной генетики микроорганизмов
Лаборатория биологии РНК и эпигенетики

Должность в ИМГ:
Старший научный сотрудник


Телефон:
+7-499-196-00-15

Адрес электронной почты:
Файл с резюме (CV):


Основные научные интересы, направления исследований и результаты

Исследование механизмов и регуляции транскрипции у прокариот. Изучение транскрипционных факторов E. coli, Deinococcus radiodurans, Xanthomonas oryzae, Thermus thermophilus и бактериофагов Р23-45 и Хр10. Исследование особенностей катализа синтеза и расщепления РНК у РНК-полимераз бактерий из разных филогенетических групп. Изучение взаимодействия РНК-полимераз с другими белками, взаимодействующими с ДНК и РНК. Новым направлением работы является исследование бактериальных белков Аргонавтов и создание гетерологичной системы для изучения их функционирования. Результаты работы представлены более чем на 30 конференциях и опубликованы в 16 статьях.



Премии, заслуги, членство в научных обществах

2017 – Медаль Российской академии наук с премией для молодых ученых за 2017 год
2014 - приз за лучший постерный доклад на 76th Harden Conference Total Transcription, September 1-5, 2014, Cambridge, UK;
2014 - победитель конкурса «Будущее молекулярной генетики» среди молодых научных сотрудников ИМГ РАН;
2013 - диплом за лучший доклад на стендовой сессии молодых ученых на юбилейной конференции, посвященной 35-летию ИМГ РАН;
2009 - премия имени Р.Б.  Хесина за лучшую курсовую работу на Кафедре молекулярной биологии МГУ;
2008 - стипендия имени академика С.Е.Северина



Список публикаций

  1. Petushkov I, Esyunina D, Mekler V, Severinov K, Pupov D, Kulbachinskiy A. Interplay between σ region 3.2 and secondary channel factors during promoter escape by bacterial RNA polymerase. Biochem J. 2017 Dec 1;474(24):4053-4064.
  2. Petushkov I, Esyunina D, Kulbachinskiy A. Possible roles of σ-dependent RNA polymerase pausing in transcription regulation. RNA Biol. 2017 Dec 2;14(12):1678-1682.
  3. Miropolskaya N, Esyunina D, Kulbachinskiy A. Conserved functions of the trigger loop and Gre factors in RNA cleavage by bacterial RNA polymerases. J Biol Chem. 2017 Apr 21;292(16):6744-6752.
  4. Agapov A, Olina A, Esyunina D, Kulbachinskiy A. Gfh factors and NusA cooperate to stimulate transcriptional pausing and termination. FEBS Lett. 2017 Mar;591(6):946-953.
  5. Petushkov I, Esyunina D, Kulbachinskiy A. σ38-dependent promoter-proximal pausing by bacterial RNA polymerase. Nucleic Acids Res. 2017 Apr 7;45(6):3006-3016. 
  6. Agapov A, Esyunina D, Pupov D, Kulbachinskiy A. Regulation of transcription initiation by Gfh factors from Deinococcus radiodurans. Biochem J. 2016 Dec 1;473(23):4493-4505. 
  7. Esyunina D, Agapov A, Kulbachinskiy A. Regulation of transcriptional pausing through the secondary channel of RNA polymerase. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016 Aug 2;113(31):8699-704.
  8. Esyunina D, Turtola M, Pupov D, Bass I, Klimašauskas S, Belogurov G, Kulbachinskiy A. Lineage-specific variations in the trigger loop modulate RNA proofreading by bacterial RNA polymerases. Nucleic Acids Res. 2016 Feb 18;44(3):1298-308.
  9. Есюнина  Д.М., Кульбачинский  А.В.  Выделение  и характеристика  рекомбинантной РНК-полимеразы Deinococcus radiodurans. Биохимия,  2015;  80  (10):  1542-1550. 
  10. Esyunina D, Klimuk E, Severinov K, Kulbachinskiy A. Distinct pathways of RNA polymerase regulation by a phage-encoded factor. Proc Natl Acad Sci U S A. 2015 Feb 17;112(7):2017-22.  
  11. Basu RS, Warner BA, Molodtsov V, Pupov D, Esyunina D, Fernandez-Tornero C, Kulbachinskiy A, Murakami KS. Structural basis of transcription initiation by bacterial RNA polymerase holoenzyme. J Biol Chem. 2014 Aug 29;289(35):24549-59. 
  12. Tagami S, Sekine S, Minakhin L, Esyunina D, Akasaka R, Shirouzu M, Kulbachinskiy A, Severinov K, Yokoyama S. Structural basis for promoter specificity switching of RNA polymerase by a phage factor. Genes Dev. 2014 Mar 1;28(5):521-31. 
  13. Miropolskaya N*, Esyunina D*, Klimasauskas S, Nikiforov V, Artsimovitch I, Kulbachinskiy A. Interplay between the trigger loop and the F loop during RNA polymerase catalysis. Nucleic Acids Res. 2014 Jan;42(1):544-52. 
  14. Pupov D*, Esyunina D*, Feklistov A, Kulbachinskiy A. Single-strand promoter traps for bacterial RNA polymerase. Biochem J. 2013 Jun 1;452(2):241-8. 
  15. Berdygulova Z*, Esyunina D*, Miropolskaya N, Mukhamedyarov D, Kuznedelov K, Nickels BE, Severinov K, Kulbachinskiy A, Minakhin L. A novel phage-encoded transcription antiterminator acts by suppressing bacterial RNA polymerase pausing. Nucleic Acids Res. 2012 May;40(9):4052-63. 
  16. Zhilina E, Esyunina D, Brodolin K, Kulbachinskiy A. Structural transitions in the transcription elongation complexes of bacterial RNA polymerase during sigma-dependent pausing. Nucleic Acids Res. 2012 Apr;40(7):3078-91.