Демидюк Илья Валерьевич | Институт молекулярной генетики

Демидюк Илья Валерьевич

Ученая степень:
доктор химических наук

Ученое звание:
Доцент


Подразделение ИМГ:
Лаборатория белковой инженерии

Должность в ИМГ:
Ведущий научный сотрудник


Телефон:
+7-499-196-18-53

Адрес электронной почты:
duk@img.ras.ru



Основные научные интересы, направления исследований и результаты

Область научных интересов: химия и биология протеолитических ферментов, применение протеаз в биотехнологии и медицине.



Преподавательская деятельность, руководство диссертациями

1998 – 2016: доцент, кафедра биотехнологии и промышленной фармации Московского университета тонких химических технологий им. М.В. Ломоносова (МИТХТ)
2005 – настоящее время: преподавание в Научно-образовательном центре ИМГ РАН
2013 – настоящее время: профессор, кафедра нано, био, информационных и когнитивных технологий Московского физико-технического института (государственного университета)
2016 – настоящее время: профессор, кафедра биотехнологии и промышленной фармации Московского технологического университета (МИТХТ)
Руководитель 2 аспирантов и 3 защищенных кандидатских диссертаций
 



Премии, заслуги, членство в научных обществах

2015 – Профессор РАН
Член редколлегии “World Journal of Biological Chemistry”
Член Ученого совета ИМГ РАН



Список публикаций

  1. Demidyuk I.V., Kalashnikov A.E., Gromova T.Yu., Gasanov E.V., Safina D.R., Zabolotskaya M.V., Rudenskaya G.N., Kostrov S.V. Cloning, sequencing, expression, and characterization of protealysin, a novel neutral proteinase from Serratia proteamaculans representing a new group of thermolysin-like proteases with short N-terminal region of precursor. // Protein Expression and Purification. 2006. V. 47. № 2. P. 551-561.
  2. Smolov M., Gottikh M., Tashlitskii V., Korolev S., Demidyuk I., Brochon J.-C., Mouscadet J.-F., Deprez E. Kinetic study of the HIV-1 DNA 3’-end processing: single-turnover property of Integrase. // FEBS Journal. 2006. V. 273. № 6. P. 1137-1151.
  3. Sharipova M.R., Shagimardanova E.I., Chastukhina I.B., Shamsutdinov T.R., Balaban N.P., Mardanova A.M., Rudenskaya G.N., Demidyuk I.V., Kostrov S.V. The expression of Bacillus intermedius glutamyl endopeptidase gene in Bacillus subtilis recombinant strains. // Molecular Biology Reports. 2007. V. 34. № 2. P. 79-87.
  4. Sharipova M., Balaban N., Kayumov A., Kirillova Y., Mardanova A., Gabdrakhmanova L., Leshchinskaya I., Rudenskaya G., Akimkina T., Safina D., Demidyuk I., Kostrov S. The expression of the serine proteinase gene of Bacillus intermedius in Bacillus subtilis. // Microbiol. Res. 2008. V. 163. № 1. Р. 39-50.
  5. Demidyuk I.V., Gasanov E.V., Safina D.R., Kostrov S.V. Structural organization of precursors of thermolysin-like proteinases. // Protein J. 2008. V. 27. № 6. P. 343-354.
  6. Gasanov E.V., Demidyuk I.V., Shubin A.V., Kozlovskiy V.I., Leonova O.G., Kostrov S.V. Hetero- and auto-activation of recombinant glutamyl endopeptidase from Bacillus intermedius. // Protein Engineering, Design, and Selection. 2008. V. 21. № 11. P. 653-658.
  7. Gromova T.Yu., Demidyuk I.V., Kozlovskiy V.I., Kuranova I.P., Kostrov S.V. Processing of protealysin precursor. // Biochimie. 2009. V. 91. № 5. P. 639-645.
  8. Demidyuk I.V., Gromova T.Y., Polyakov K.M., Melik-Adamyan W.R., Kuranova I.P., Kostrov S.V. Crystal structure of protealysin precursor: insights into propeptide function. // J. Biol. Chem. 2010. V. 285. № 3. P. 2003-2013.
  9. Shubin A.V., Demidyuk I.V., Kurinov A.M., Demkin V.V., Vinogradova T.V., Zinovyeva M.V., Sass A.V., Zborovskaya I.B., Kostrov S.V. Cathepsin D messenger RNA is downregulated in human lung cancer. // Biomarkers. 2010. V. 15. № 7. P. 608-613.
  10. Demidyuk I.V., Shubin A.V., Gasanov E.V., Kostrov S.V. Propeptides as modulators of functional activity of proteases. // Biomolecular concepts. 2010. V. 1. № 3-4. P. 305-322.
  11. Sabirova A.R., Rudakova N.L., Balaban N.P., Ilyinskaya O.N., Demidyuk I.V., Kostrov S.V., Rudenskaya G.N., Sharipova M.R. A novel secreted metzincin metalloproteinase from Bacillus intermedius. // FEBS Lett. 2010. V. 584. № 21. P. 4419-25.
  12. Bozhokina E.S., Tsaplina O.A., Efremova T.N., Kever L.V., Demidyuk I.V., Kostrov S.V., Adam T., Komissarchik Ya.Yu., Khaitlina S.Yu. Bacterial invasion of eukaryotic cells can be mediated by actin-hydrolyzing metalloproteases grimelysin and protealysin. // Cell biology international. 2011. V. 35. № 2. P. 111-118.
  13. Safina D., Rafieva L., Demidyuk I., Gasanov E., Chestukhina G., Kostrov S. Involvement of propeptides in formation of catalytically active metalloproteinase from Thermoactinomyces sp. // Protein and Peptide Letters. 2011. V. 18. № 11. P. 1119-1125.
  14. Klykov S.P., Kurakov V.V., Vilkov V.B., Demidyuk I.V., Gromova T.Y., Skladnev D.A. A cell population structuring model to estimate recombinant strain growth in a closed system for subsequent search of the mode to increase protein accumulation during protealysin producer cultivation. // Biofabrication. 2011. V. 3. № 4. P. 045006.
  15. Tsaplina O., Efremova T., Demidyuk I., Khaitlina S. F-actin is a substrate for protealysin, a metalloprotease of invasive Serratia proteamaculans. // FEBS Journal. 2012. V. 279. № 2. P. 264-274.
  16. Demidyuk I.V., Shubin A.V., Gasanov E.V., Kurinov A.M., Demkin V.V., Vinogradova T.V., Zinovyeva M.V., Sass A.V., Zborovskaya I.B., Kostrov S.V. Alterations in gene expression of proprotein convertases in human lung cancer have a limited number of scenarios. // PLoS ONE. 2013. V. 8. № 2. P. e55752.
  17. Demidyuk I.V., Gromova T.Y., Kostrov S.V. Protealysin. / In: Handbook of proteolytic enzymes, 3rd Edition. Edited by Neil D. Rawlings and Guy Salvesen. // Oxford: Academic Press, 2013. V. 1. P. 597-602.
  18. Mikhailova A.G., Khairullin R.F., Demidyuk I.V., Kostrov S.V., Grinberg N.V., Burova T.V., Grinberg V.Y., Rumsh L.D. Cloning, sequencing, expression, and characterization of thermostability of oligopeptidase B from Serratia proteamaculans, a novel psychrophilic protease. // Protein Expression and Purification. 2014. V. 93. P. 63-76.
  19. Shubin A.V., Demidyuk I.V., Lunina N.A., Komissarov A.A., Roschina M.P., Leonova O.G., Kostrov S.V. Protease 3C of hepatitis A virus induces vacuolization of lysosomal/endosomal organelles and caspase-independent cell death. // BMC Cell Biology. 2015. V. 16. P. 4.
  20. Demidyuk I.V., Gromova T.Yu., Kostrov S.V. The propeptide is required for in vivo formation of active protealysin. // Protein and Peptide Letters. 2015. V. 22. № 6. P. 509-513.
  21. Shubin A.V., Demidyuk I.V., Komissarov A.A., Rafieva L.M., Kostrov S.V. Cytoplasmic vacuolization in cell death and survival. // Oncotarget. 2016. V. 7. № 34. P. 55863-55889.