Лаборатория молекулярной диагностики | Институт молекулярной генетики РАН

Демкин Владимир Витальевич

Заведующий лабораторией
Ученая степень:
кандидат медицинских наук
Ученое звание:
без ученого звания
Адрес электронной почты:
Телефон:
   
   

Список сотрудников

Демкин Владимир Витальевич, кмн
Казаков Андрей Аркадьевич, инж. 1-й кат.
Кошечкин Станислав Игоревич, инж. 1-й кат.
Зайцева Марина Валентиновна, инж. 1-й кат.
Воронцова Марина Михайловна, вед.инженер
Богданова Светлана Александровна, лаборант

   
   

Основные направления исследований

  1. Генодиагностика инфекционных заболеваний человека и животных. Популяционная вариабельность генетических маркеров, определяющих индивидуальные или групповые свойства микроорганизмов, разработка систем детекции и генотипирования вирусов и бактерий.
  2. Микробиота женской репродуктивной системы и ее изменение в различные периоды жизни и под действием различных факторов.
  3. Внеклеточные циркулирующие нуклеиновые кислоты, их значение в качестве диагностических маркеров особых и патологических состояний, включая беременность и онкологические заболевания.
   
   

Основные достижения

  1. На основе реакции амплификации ДНК с последующим анализом полиморфизма длин рестрикционных фрагментов и ПЦР в реальном времени разработаны системы детекции и идентификации различных групп герпесвирусов человека, включая ВПГ1+ВПГ2+ ЦМВ+ ВЭБ, ВПГ1+ ВПГ2+ ЦМВ+ ВЭБ+ ВГЧ8 и ВГЧ-6+ ВГЧ-7. Получены данные о распространении герпесвирусных инфекций у пациентов урологических,  гинекологических и офтальмологических отделений клиник г. Москвы. Показана высокая частота выявления различных видов герпесвирусов среди доноров органов, изучена динамика активизации герпесвирусных инфекций и ее влияние на течение раннего посттрансплантационного периода у реципиентов, получивших органы от инфицированных доноров в условиях современной клиники.
  2. Разработаны системы типирования делеционных областей геномов мико­бактерий туберкулез­ного комплекса. Пока­зано, что изученные штаммы M.tuberculosis и M.bovis имеют видоспецифические структурные особенности в этих областях, позволяющие дифференцировать данные виды. Показана популяционная стабильность области RD7 в штаммах M.tuberculosis, выделенных от больных легочным туберкулезом в различных районах Казахстана. Проведено типирование популяции микобактерий туберкулеза, циркулирующих на территории Монголии.
  3. Разработан метод идентификации и дифференциации видов семейства Chlamydiaceae в соответствии с современной таксономией, основанный на анализе рестриционных паттернов маркерной области гена omp2. Впервые были определены нуклеотидные последовательности практически всего гена omp2 у двух видов хламидий C. suis и C. felis (AY286314, AY286315). В геноме хламидий найдены новые генетические области, которые могут служить маркерами при идентификации хламидий.
  4. Определены генетические области, которые могут служить маркерными участками для идентификации лактобактерий ацидофильного комплекса, доминирующих в вагинальных микробиотах. Разработаны системы детекции и идентификации вагинальных лактобактерий методом ПЦР в реальном времени, предназначенные для изучения лактобактериального пейзажа в вагинальных микробиотах человека. Получены первичные данные о закономерностях распространения различных видов лактобактерий в вагинальных микробиоценозах женщин в центральной части России.
  5. Разработаны системы определения фетальной ДНК в крови матери на основе маркера Y-хромосомы. Разработаны системы определения экспрессии некоторых генов человека, активизирующихся при онкологических заболеваниях.
    
    

Основные публикации

  1. Войлокова Р.Я., Николаева Н.П., Кормер А.Я., Шумаков Д.В., Казаков Э.Н., Семеновский М.Л., Алферов А.В., Хоробрых В.В., Демкин В.В., Честухин В.В. Герпесвирусная инфекция у кардиохирургических больных. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2000, №2, стр.24-27.
  2. Demkin, V.V., Edelstein, M.V., Zimin, A.L., Edelstein, I.A., Suvorov M.M. Detection of sequence variation in PCR-amplified fragments of omp2 gene from three species of the family Chlamydiaceae using agarose gel electrophoresis containing bisbenzimide-PEG1. FEMS Microbiol Lett. 2000;184(2):215-218.
  3. Скотникова О.И., Соболев А.Ю., Демкин В.В., Николаева Н.П,  Носова Е.Ю., Исаева Е.Л., Мороз А.М., Литвинов В.И. Использование метода нестед ПЦР в диагностике туберкулеза. Бюлл. Эксп. Биол. Мед. РАМН, 2000, №6, с. 717-720.
  4. Иваненко Т. В., Москалец О. В., Сучков С. В., Пpокопенко Е. И., Демкин В. В., Гнедой С. Н. Использование метода NESTED-полимеpазной цепной pеакции для диагностики цитомегаловиpусной инфекции пpи тpансплантации почки. Клиническая лабораторная диагностика 2000, №9, стр.10-11.
  5. Войлокова Р.Я., Хоробрых В.В., Николаева Н.П., Круглова А.И., Арзуманов В.С., Хоробрых Т.В., Демкин В.В., Ионова В.В., Захаревич В.М., Шумаков Д.В.,  Мочкин И.А. Герпесвирусная инфекция у больных ишемической болезнью сердца и клапанной патологией сердца. Сердечно-сосудистые заболевания. Бюлл. НЦССХ им. А.Н.Бакулева РАМН, 2001, т.2, №6, стр.205.
  6. Войлокова Р.Я., Николаева Н.П., Витязев Г.А., Круглова А.И., Абрамов В.Ю., Хоробрых В.В., Хубутия М.Ш., Порунова А.К., Демкин В.В. Влияние герпесвирусной инфекции у доноров крови и доноров аллотрансплантата на течение раннего послеоперационного периода. Вестник трансплантологии и искусственных органов, 2002, №1, стр.18-20.
  7. Круглова А.И., Войлокова Р.Я., Николаева Н.П., Демкин В.В., Нюхалова Ю.В., Абрамов В.Ю., Хоробрых В.В. Детекция и идентификация четырех типов герпесвирусов человека у доноров органов и больных с сердечно-сосудистой патологией. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2002, 3, стр. 40-41.
  8. Demkin, V.V., Kruglova, A.I., Nikolaeva, N.P., Yurchenko J.Y. Detection and species identification of four human herpesviruses using polymerase chain reaction coupled with restriction endonuclease analysis. J. Virol. Meth., 2002; 103/2, pp. 121-128.
  9. Палеев Ф.Н., Кошелева И.В., Котова А.А., Дурова О.М., Гнучев Н.В., Габибов А.Г., Демкин В.В., Сучков С.В. Каталитические аутоантитела у больных с аутоиммунными миокардитами. Медицинская иммунология, 2002, т. 4, N 2, С. 209-210.
  10. Римарчук Г.В., Полякова С.И., Колосова Т.Г., Демкин В.В., Сучков С.В. Иммунологический и ПЦР мониторинг хронических вирусных гепатитов у детей. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2002, т.XII, №1, стр. 27.
  11. Найманов А.Х., Овдиенко Н.П., Осипова Е.П., Солодова И.В., Суворов В.С., Корнева И.Н., Демкин В.В. Полимеразная цепная реакция (система senX3-regX3) при диагностике туберкулеза крупного рогатого скота. Ветеринария. 2004,  т.10, стр. 3-5.
  12. Корнева И.Н., Демкин В.В. Конструирование ПЦР-тест-систем для обнаружения и идентификации микобактерий туберкулеза у животных. Ветеринарная патология, 2004, №1-2, стр. 95-96.
  13. Круглова, А.И., Николаева, Н.П., Нюхалова, Ю.В., Баринский, И.Ф., Алимбарова, Л.М., Демкин, В.В. Анализ генетического полиморфизма ДНК вируса простого герпеса 1 и 2 типов из лабораторных штаммов и клинического материала от пациентов с генитальным герпесом. Вопросы вирусологии. 2004, №1, стр. 23-27.
  14. Решетняк Д. В., Кузнецова Т. В., Кобылянский А.Г., Клюквина Н. Г., Решетняк Т. М., Насонов Е. Л. Уровень нитратов в сыворотке крови пациентов с системной красной волчанкой и антифосфолипидным синдромом. Терапевтический архив 2004.- т. 76(5), стр. 19-22.
  15. Бондаренко О. Н., Галстян Г. Р., Кузнецова Т. В., Кобылянский А. Г., Анциферов М. Б. Метаболизм L-аргинина у больных сахарным диабетом с диабетической полинейропатией и язвенными дефектами стоп. Проблемы эндокринологии 2004, №1, стр.3-8.
  16. Войлокова Р.Я., Хоробрых В.В., Воронкова О.И., Кейян А.В., Вакуев И.А., Желткова Е.А., Павлов А.Б., Горбунов В.В., Корнева И.Н., Чумак О.Б., Демкин В.В., Филимонов В.А., Картавова Л.А., Калугина Т.Б., Халилулин Т.А. Особенности течения цитомегаловирусной инфекции и ее лечение у больных с сердечно-сосудистой патологией. Вестник трансплантологии и искусственных органов 2005, т.2., стр. 21-25.
  17. Demkin, V.V., Zimin A.L. A new amplification target for PCR-RFLP detection and identification of Chlamydiaceae species. Arch Microbiol. 2005 183(3):169-75.
  18. Марчук Н.В., Демкин В.В., Морозова Л.Г., Харлашина Л.Я., Евдокимов В.В., Ефремов Е.А. Сравнительная оценка определения Chlamydia trachomatis в моче и соскобах из уретры методом ПЦР с использованием разных наборов плазмидных праймеров у больных хроническим фиброзирующим простатитом. Андрология  и генитальная хирургия, 2005, №2, стр. 55-60
  19. Вареница А.Н., Герасимова А.А., Демкин В.В., Костюк Э.В., Панина О.Б., Клименко П.А. Герпесвирусная инфекция и беременность. Российский вестник акушера-гинеколога. 2006, №5, стр. 8-11.
  20. Уездина А.В., Демкин, В.В. Эпизоотология и лабораторная диагностика криптоспоридиоза кур. Объединенный научный журнал, 2006, №27, стр. 72-74
  21. Войлокова Р.Я., Корнева И.Н., Демкин В.В., Абрамов В.Ю., Хоробрых Т.В., , Кормер А.Я., Хоробрых В.В. Результат аллотрансплантации сердца от доноров, инфицированных вирусом Эпштейна-Барр. Аллергология и иммунология 2007, т.8, №1, стр. 234.
  22. Демкин В.В., Корнева И.Н., Рязанова Ю.А., Муминов Т.А., Бейсембаева Ш.А., Жакипбаева Б.Т., Шопаева Г.А., Даулетбакова А.М. RD7 генотипирование штаммов M. tuberculosis, выделенных от больных легочным туберкулезом на территории Казахстана. Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. 2008, №2, стр. 18-22.
  23. Литвинов В., Черепахина Н., Санаев А., Котенко О., Матушевский И., Величковский Б., Винницкий Л., Перлин Д., Демкин В., Сучков С. Хронический пиелонефрит: особенности иммунопатогенеза и принципы клинической иммуногенодиагностики. Врач 2008, №1, стр.12-17.
  24. Демкин В.В. Биоинформационный анализ нуклеотидных последовательностей бактерий, хранящихся в GenBank. Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. 2009, №2, стр. 36-39.
  25. Демкин В.В. Биоинформационный анализ нуклеотидных последовательностей боррелий, имеющихся в GENBANK. Национальные приоритеты России, 2009, №2, с. 169-170.
  26. Shubin AV, Demidyuk IV, Kurinov AM, Demkin VV, Vinogradova TV, Zinovyeva MV, Sass AV, Zborovskaya IB, Kostrov SV. Cathepsin D messenger RNA is downregulated in human lung cancer. Biomarkers. 2010, Vol. 15(7) P. 608–613
  27. Энхсайхан, Д., Лопарёв, В., Бостик, В., Туул, Р., Демкин, В.В., Нимадава П. Генотипирование вирусов Варицелла-Зостер, выделенных на территории Монголии. Вопросы вирусологии 2010 №5, стр. 40-43.
  28. Демкин В. В., Куринов А. М., Кузьмичева Р. А., Карлина В. П., Корнева И. Н., Сучков С. В. Комплексное обследование инфицированности урогенитального тракта женщин методом ПЦР с использованием мультиплексных тест-систем. Клиническая лабораторная диагностика 2010 №8, стр. 49-51.
  29. Демкин В.В. Использование табличного редактора  Excel  для анализа выровненных нуклеотидных последовательностей. Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. 2010, №3, стр. 40-41.
  30. Демкин, В.В., Лопарёв В. Н. Генетическая вариабельность и генотипирование вирусов Варицелла-Зостер. Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. 2010, №4, стр. 19-23.
  31. Кобылянский А. Г., Сандин М. Ю., Козлова В. И., Алиханов Б. А., Демкин В. В. Определение антител к циклическому цитруллинированному пептиду при ревматоидном артрите. Клиническая лабораторная диагностика.- 2011.- 6.- С. 36-39.
  32. Кобылянский А.Г., Некрасов А.Н., Козлова В.И., Сандин М.Ю., Алиханов Б.А., Демкин В.В. Выявление новых эпитопов антител к филаггрину в молекуле белка филаггрина // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины.- 2011.- Т. 151. № 5. С. 552-555.
  33. Кириллова Н.В., Федосова Е.А., Наранбат Н., Оюунтуяа Т., Буянхишиг Б., Энхсайхан Д., Демкин В.В., Нимадава П. Структура популяции M. tuberculosis в Монголии, по результатам генотипирования  полиморфизмов больших последовательностей. Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. 2011 № 4, стр. 3-7.
  34. Демкин В. В., Кириллова Н. В. Специфичные мотивы в геномах семейства Сhlamydiaceae.  // Молек.генет. микробиол. вирусол.- 2012.- No.3.- Стр. 26-27.
  35. Миронкова Е.А., Демкин В.В., Слепова О.С., Садохина Т.С., Макаров П.В.,  Кугушева А.Э. Диагностика и роль ВГЧ-6 инфекции при кератопластике высокого риска. Российский офтальмологический журнал. 2012, №3, стр. 30-34
  36. Миронкова Е.А., Макаров П.В., Слепова О.С., Гундорова Р.А., Кугушева А.Э., Демкин В.В., Садохина Т.С., и др. Инфицированность донорского материала вирусами группы герпеса как возможная причина развития болезни трансплантата при сквозной кератопластике. Вестник трансплантологии и искусственных органов. 2012,  Т. XIV. №4, стр. 48-51.
  37. Demidyuk IV, Shubin AV, Gasanov EV, Kurinov AM, Demkin VV, Vinogradova TV, Zinovyeva MV, Sass AV, Zborovskaya IB, Kostrov SV. Alterations in gene expression of proprotein convertases in human lung cancer have a limited number of scenarios. PLOS ONE. 2013, 8(2): e55752"
  38. Демкин В.В. Гемотропные микоплазмозы (гемоплазмы, гемобартонеллы) кошек и собак. Российский ветеринарный журнал. Мелкие домашние и дикие животные. 2014, №4, стр. 23-28